Сфера биотехнологий является одной из ключевых областей технологий, влияющих на инновационное развитие современной экономики. В статье рассматриваются закономерности стадии развития наукоёмкого проекта в сфере биотехнологий и успешного метода его финансирования. Результаты выражены в форме рекомендаций по выбору методов финансирования в зависимости от текущей стадии развития проекта. Разработанный подход основан на поэтапном введении доступных и выявленных внешних источников финансирования на разных стадиях жизненного цикла проекта. В связи с отсутствием спроса на инновационную продукцию и ее низкой конкурентоспособностью на первоначальной стадии жизненного цикла инвестиции в наукоёмкие предприятия осуществляются за счет государственных средств через государственные контракты на НИОКР и грантовую систему. Однако, одних только бюджетных средств на ранних стадиях недостаточно, в связи с чем негосударственные инструменты финансовой поддержки также должны быть задействованы на начальной стадии финансирования наукоёмких проектов. На второй стадии развития наукоёмкого проекта, финансирование осуществляется за счет других инструментов. Влияние государства будет снижаться, создавая условия для инвестиций из ресурсов компаний и фондов. На третьей стадии влияние государства становится еще менее значимым, и государственно-частное партнёрство становится необходимым для коммерциализации инноваций. Финансирование наукоёмких проектов должно осуществляться поэтапно с установлением ответственности за расходование бюджетных средств при недостижении положительного результата.